Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNHIT3Q15649 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNHIT3Q15649 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms