Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TCEA2Q15560 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TCEA2Q15560 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms