Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.825e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.812e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SPATA5L1-204ENST00000531970 2464 ntTSL 220.08■□□□□ 0.85e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.792e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.692e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.525e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.522e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.512e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MIIP-203ENST00000466860 1709 ntTSL 517.16■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 PPP2R3B-209ENST00000484364 732 ntTSL 216.94■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.295e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MAPK7-214ENST00000573417 418 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MIIP-207ENST00000498685 1392 ntTSL 216.34■□□□□ 0.215e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SLC4A1AP-205ENST00000613517 819 ntTSL 515.35■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 PPP2R3B-207ENST00000477636 519 ntTSL 515.29■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.015e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 514.93□□□□□ -0.025e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 214.6□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.215e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MAT1A-204ENST00000485270 2661 ntTSL 212.87□□□□□ -0.355e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.415e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-220ENST00000560654 784 ntTSL 512.03□□□□□ -0.485e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MAT1A-203ENST00000480845 790 ntTSL 311.77□□□□□ -0.535e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-216ENST00000560031 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-206ENST00000468727 667 ntTSL 311.47□□□□□ -0.575e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 PSMB2-201ENST00000373237 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-212ENST00000559454 1768 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 RAPGEF5-204ENST00000420196 660 ntTSL 511.22□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-211ENST00000486829 428 ntTSL 311.05□□□□□ -0.645e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-207ENST00000473779 669 ntTSL 311.05□□□□□ -0.645e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-202ENST00000396509 1834 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-209ENST00000559095 427 ntTSL 310.29□□□□□ -0.765e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-215ENST00000559963 794 ntTSL 210.26□□□□□ -0.775e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SLC4A1AP-204ENST00000613058 2966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 BBS5-203ENST00000443151 583 ntTSL 59.92□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-209ENST00000554063 660 ntTSL 39.88□□□□□ -0.832e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.835e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.835e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 DNHD1-203ENST00000472080 2288 ntTSL 29.75□□□□□ -0.855e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-217ENST00000560119 2053 ntTSL 29.71□□□□□ -0.855e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-211ENST00000559423 895 ntTSL 59.37□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.935e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 RAPGEF5-212ENST00000620335 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.955e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-208ENST00000553859 602 ntTSL 39.11□□□□□ -0.952e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-213ENST00000554446 1129 ntTSL 59.04□□□□□ -0.962e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MCM9-204ENST00000425154 752 ntTSL 39.04□□□□□ -0.965e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-208ENST00000559040 471 ntTSL 59□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 RAPGEF5-206ENST00000458533 869 ntTSL 58.9□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-204ENST00000558145 567 ntTSL 48.8□□□□□ -15e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-218ENST00000560138 722 ntTSL 58.65□□□□□ -1.025e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-214ENST00000559883 991 ntTSL 48.37□□□□□ -1.075e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-206ENST00000558775 813 ntTSL 38.37□□□□□ -1.075e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.095e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF1-215ENST00000598444 425 ntTSL 28.2□□□□□ -1.15e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SLC4A1AP-202ENST00000427424 906 ntTSL 38.05□□□□□ -1.125e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.125e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.155e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.155e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 RAPGEF5-205ENST00000451559 836 ntTSL 57.67□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.215e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.245e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-210ENST00000559208 861 ntTSL 57.23□□□□□ -1.255e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 BBS5-206ENST00000475571 566 ntTSL 47.19□□□□□ -1.265e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.275e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-207ENST00000558956 641 ntTSL 56.96□□□□□ -1.35e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 GALK2-222ENST00000561074 550 ntTSL 46.73□□□□□ -1.335e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 TBCEL-208ENST00000533134 966 ntTSL 56.2□□□□□ -1.425e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 TBCEL-209ENST00000533169 1210 ntTSL 35.95□□□□□ -1.465e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 HAUS4-219ENST00000556421 851 ntTSL 25.54□□□□□ -1.522e-13■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-215ENST00000498517 787 ntTSL 55.38□□□□□ -1.555e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-205ENST00000468466 514 ntTSL 45.2□□□□□ -1.585e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 BAG1-209ENST00000493917 526 ntTSL 55.16□□□□□ -1.585e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-209ENST00000477833 757 ntTSL 35.12□□□□□ -1.595e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 SRRM3-202ENST00000479284 589 ntTSL 34.72□□□□□ -1.655e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 RAPGEF2-206ENST00000505478 838 ntTSL 54.66□□□□□ -1.665e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ARHGEF3-210ENST00000481422 567 ntTSL 44.31□□□□□ -1.725e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.075e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.754e-7■■■■□ 25.1
PCBP2Q15366 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.421e-8■■■■□ 25
PCBP2Q15366 ENPP1-203ENST00000486853 732 ntTSL 227.72■■■□□ 2.037e-9■■■■□ 25
PCBP2Q15366 ENPP1-204ENST00000513998 3107 ntTSL 520.07■□□□□ 0.87e-9■■■■□ 25
PCBP2Q15366 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.287e-9■■■■□ 25
PCBP2Q15366 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-9■■■■□ 25
PCBP2Q15366 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-9■■■■□ 25
PCBP2Q15366 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 513.31□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 25
PCBP2Q15366 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.512e-10■■■■□ 25
PCBP2Q15366 RYK-206ENST00000484106 1258 ntTSL 513.4□□□□□ -0.261e-8■■■■□ 25
PCBP2Q15366 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.284e-6■■■■□ 25
PCBP2Q15366 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 25
PCBP2Q15366 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.276e-7■■■■□ 25
PCBP2Q15366 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.267e-7■■■■□ 25
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