Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SF3A1-203ENST00000444440 777 ntTSL 512.03□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 8.8
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PCBP1Q15365 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.826e-6■□□□□ 8.7
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PCBP1Q15365 RPL29-201ENST00000294189 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 RPL29-206ENST00000481629 880 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 RPL29-205ENST00000480306 719 ntTSL 29.92□□□□□ -0.821e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 RPL29-207ENST00000486565 574 ntTSL 1 (best)7.87□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 TUBA1C-208ENST00000552125 575 ntTSL 412.09□□□□□ -0.476e-20■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 TUBA1C-206ENST00000549818 536 ntTSL 410.51□□□□□ -0.736e-20■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 TUBA1C-204ENST00000549183 696 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.86e-20■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 511.97□□□□□ -0.491e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 211.66□□□□□ -0.541e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-203ENST00000463817 853 ntTSL 29.52□□□□□ -0.891e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 59.52□□□□□ -0.891e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 28.35□□□□□ -1.071e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.121e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 37.71□□□□□ -1.181e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.281e-14■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-215ENST00000535149 2882 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.713e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-201ENST00000276079 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.773e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 28.04□□□□□ -1.123e-9■□□□□ 8.7
PCBP1Q15365 NONO-210ENST00000472185 397 ntTSL 57.38□□□□□ -1.233e-9■□□□□ 8.7
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