Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF4Q15306 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF4Q15306 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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