Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB35Q15286 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB35Q15286 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB35Q15286 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms