Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PDCD1Q15116 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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