Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLCA4Q14CN2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLCA4Q14CN2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms