Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHD4Q14839 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHD4Q14839 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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