Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GTF2H2Q13888 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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GTF2H2Q13888 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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GTF2H2Q13888 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2H2Q13888 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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