Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DDX39BQ13838 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms