Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ALCAMQ13740 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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