Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P11Q13670 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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