Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
EIF4EBP1Q13541 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms