Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMAD4Q13485 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMAD4Q13485 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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