Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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