Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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ITGB3BPQ13352 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGB3BPQ13352 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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