Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAA1Q13131 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKAA1Q13131 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms