Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLFQ13129 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RLFQ13129 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLFQ13129 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RLFQ13129 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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