Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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