Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC15Q0P6D6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms