Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms