Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TNP2Q05952 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms