Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNB3Q05901 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms