Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GBE1Q04446 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms