Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CENPCQ03188 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPCQ03188 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms