Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CYP4A11Q02928 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms