Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUCB1Q02818 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUCB1Q02818 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms