Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNTN2Q02246 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms