Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
OTUD4Q01804 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
OTUD4Q01804 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms