Protein–RNA interactions for Protein: P54274

TERF1, Telomeric repeat-binding factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TERF1P54274 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TERF1P54274 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TERF1P54274 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TERF1P54274 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TERF1P54274 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TERF1P54274 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TERF1P54274 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms