Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCAMP50895 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BCAMP50895 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAMP50895 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAMP50895 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAMP50895 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAMP50895 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BCAMP50895 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BCAMP50895 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BCAMP50895 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms