Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LHX2P50458 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms