Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ME1P48163 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ME1P48163 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ME1P48163 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ME1P48163 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ME1P48163 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms