Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms