Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCAMP43121 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCAMP43121 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCAMP43121 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MCAMP43121 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms