Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PPARGP37231 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PPARGP37231 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PPARGP37231 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms