Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
POLR2IP36954 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2IP36954 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms