Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LTBRP36941 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LTBRP36941 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LTBRP36941 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LTBRP36941 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms