Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TGFBR1P36897 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms