Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms