Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COPB2P35606 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COPB2P35606 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPB2P35606 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPB2P35606 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPB2P35606 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPB2P35606 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms