Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCKBRP32239 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms