Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA9P31269 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA9P31269 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms