Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CNGA1P29973 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms