Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP1P29466 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP1P29466 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP1P29466 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms