Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRMP28827 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRMP28827 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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