Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NFKBIAP25963 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms