Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YY1P25490 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
YY1P25490 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
YY1P25490 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YY1P25490 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
YY1P25490 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YY1P25490 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YY1P25490 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YY1P25490 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms