Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
APCP25054 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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APCP25054 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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APCP25054 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
APCP25054 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
APCP25054 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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APCP25054 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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APCP25054 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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